在陈寿的《三国志·魏书·武帝纪》中叙述赤壁之战时，他并未提及“火攻”这件事。而是说曹军遇到了瘟疫，导致士兵大部分死亡，曹操才不得已领兵撤退的。而在《三国志·吴书·吴主传》中甚至说曹操是自己烧掉剩余的战船带军撤回的。赤壁之战后曹操兵败“十分气愤”，曾写信给孙权称是他自己烧掉了战船，反倒将好名声留给了周瑜。
面对这些记载，越来越多的人开始相信曹操之所以会失败，是因为军队遭遇了可怕的瘟疫或其他疾病，才导致战斗力丧失，让吴军有机可乘的。而根据后世人的分析，这种疾病很可能是血吸虫病。理由有以下几点：第一，我国古代早已存在血吸虫病，在7世纪初的《诸病源候论》中也有关于血吸虫病的记载。而两湖一代很早就是血吸虫病的高发区，在出土于1973年的长沙马王堆一号墓中的女尸肠壁及肝脏组织中，研究人员就发现了大量血吸虫卵。那么曹军驻扎在赤壁一带，兵士发生血吸虫病就更不足为奇了。
第二，赤壁之战前，曹军迁徙的时间与血吸虫病的易感染季节也正好相符。秋季是血吸虫病流行的季节，而此时的曹军正好迁徙到此处，驻扎为营并开始在水中大规模地训练水军，为向孙刘联军发动攻击作准备。血吸虫在人体中的潜伏期通常为一个月，在一个月前他们还能大败刘军，但一个月后冬季来临，两军进入决战状态时，那些被感染的士兵开始出现急性症状。病痛折磨着曹军，使号称八十几万的曹军溃不成军，不堪一击。
但同时也有相关学者提出了针对血吸虫病的疑问，首先他们指出，同样参加赤壁之战，唯独曹军被血吸虫感染了，为何吴军却没有呢？仅仅用免疫力就能说明这一点吗？他们还相继提出了针对以上理由的反驳。
反对者首先指出，曹操是在邺而不是在疫区江陵训练水军的，而邺并不是血吸虫病疫区，感染的可能性不是很大。其次在潜伏期上，反对者也指出，血吸虫病的潜伏期一般在一个月左右，少数在两个月以上，但潜伏期越长，发病的症状也就越轻。因此他们认为，即使曹军是在秋季患上了血吸虫病，那么等到大战爆发前的冬季才发病的曹军症状应该相对较轻，而不至于毫无抵抗力。
