孙中山遗体
遗体整个防腐过程历时两天。可能当时考虑到取出的内脏日后会节外生枝，协和医院对外界宣布，孙中山的内脏在进行医学检查之后，已经作火化处理。
但实际上，由于诊断结果是孙中山患有肝癌，所以为了研究之用，协和医院将取出的肝脏以及制成的肝脏病理切片和腊块标本，收藏于该院病理研究室内。
此事对孙中山夫人宋庆龄及其子孙科以及在医院照料的国民党要员吴铁城、郑洪年等也是保密的，他们被告知，肝脏已焚化。
（上图）孙中山与宋庆龄
风波突起
“档案显示，孙中山逝世后，肝脏确实留存于世。”南京市档案局副局长王菡回忆说，档案记载，1942年初春，日军强行进入美国人开办的协和医院时，发现该院研究室内藏有孙中山的肝脏、肝脏切片和腊块等，其中还包括一册总理的临床记录报告。
（上图）档案显示，孙中山逝世后，肝脏确实留存于世
日军立刻严加防范，不准中国人触碰和过问。两名日军军官来到病案库，取走了与孙中山相关的所有档案资料。这一重大信息传到南京汪伪政府后，汪精卫很是着急，他立即派伪外交部长褚民谊赶赴北平，与日方商洽索回肝脏等事宜。经商妥，日军交出肝脏、肝脏切片以及腊块标本，由褚民谊带回南京。
柳暗花明
孙中山纪念馆原馆长范方镇说，当时汪伪政权为迎接孙中山“灵脏”，举行了盛大的活动。档案显示，1942年4月1日，在中山陵正式举行了孙中山肝脏安放仪式。
