但从阿波罗计划探测结果发现， 月球的化学成份与小行星或其它太阳系中物体的成份不同，与地球的化学成份也不同， 这就使同源说和爆炸说有了疑点。
在这些正统假说之外， 对于月球的来历还有一些非常大胆而有趣的设想。 1970年， 俄国科学家柴巴可夫（Alexgander Scherbakov）和米凯·威新（Mihkai Vasin） 提出一个令人震惊的“太空船月球”理论， 来解释月球起源。他们认为，月球事实上不是地球的自然卫星，而是一颗经过某种智慧生物改造的星体，加以挖掘改造成太空船，其内部载有许多该文明的资料，月球是被有意的置放在地球上空，因此所有的月球神秘发现，全是至今仍生活在月球内部的高等生物的杰作。
阿波罗计划老照片
有台湾飞碟研究教父之称的吕应钟教授也撰写过一篇题为《月球是外星人所造的？》文章，支持月球由外星人造的观点。此外，某一台湾个人网站也搜集了一些目前用传统科学无法解释的月球奇妙神秘现象方面的资料。根据他们的资料，月球的神秘之处主要表现在以下几个方面：
宇航员背后神秘建筑物
日月与地球之间的奇妙。太阳到地球的距离约为月球到地球距离的395倍；太阳直径约为月球直径的395倍；这使得从地球上看起来太阳和月亮的圆面一样大， 两个约略同大的天体，一个管白天，一个管夜晚。这是巧合吗？作为卫星它太大了，月球直径是地球的27％。火星、木星、土星也有自己的卫星，且均不止一个，但它们的最大卫星的直径分别仅为其母星的 0.34％、3.5%和3.75%。地球的卫星——月球， 是不是“大得不自然”。
