据悉，临汾市文物局、吉县文管所和人祖山文化旅游开发公司考古部在山西省考古研究所田建文教授的指导下，从2011年8月13日至10月9日对人祖庙遗迹进行了“抢救性”清理。
共发现遗物291件（套），遗物分属战国、汉唐、宋元、明清、民国五个时期，其中有战国时期陶豆柄1件、绳纹残筒瓦3件；汉唐时期残筒瓦和瓦当各1件；宋元时期“景德元宝”（1004-1007年）、“崇宁通宝”（1102-1106年）、“宣和通宝”（1119-1125年）铜钱、条砖和瓦当5件；
（上图）人祖庙或为最早祭祀女娲祭坛
明清时期的发现，大多为琉璃残构件、陶制残构件、瓦当、戥子、瓷碗和“乾隆通宝”、“嘉庆通宝”、“咸丰通宝”铜钱及“光绪元宝”、“大清铜币”铜圆等，并在娲皇宫积土中找到人头骨、木函残片和许多动物骨头。经北京大学考古文博学院的碳十四测年，人头骨距今6200年；动物骨头距今2100至900年。
（上图）人祖庙或为最早祭祀女娲祭坛
包括国家文物局原副局长张柏和故宫博物院副院长李文儒在内的23位专家都认为吉县人祖庙是中国目前发现最早祭祀女娲的考古遗迹。其中发现的距今2100至900年的动物骨头或许就是祭祀品的遗骨。有人推测，娲皇宫位于人祖山主峰顶端，最早可能是氏族祭天或祭祖的祭坛，尔后经历代修建，建过享堂，最后演变成为人祖庙。事实上，人祖庙上现存的遗迹，都是几经复修的明清混合建筑。
