相传明太祖朱元璋死后，为了防止后人盗墓，曾于同一天从南京十三个城门同时出殡，而且车马仪仗完全相同，使人难辨真伪。所以，有传说孝陵的地宫中是空的，朱元璋并没有真的在这里安葬。
民间还有朱元璋真身葬于南京朝天宫或北京万岁山的说法。他们的成果融合进了南京大学与中山陵园“世界遗产明孝陵综合研究科研合作协议”之中。
（上图）陵宫
古代帝王生前居住的地方叫皇宫，而死后安息的地方叫陵宫，也叫神宫。神宫监，明朝管理神宫的中央专设机构，规定必须靠近神宫但又不能在神宫内。600多年的风雨飘摇，神宫监早已被尘土湮没。
在洪武皇帝的玄宫昭然于世以后，探寻神宫监的具体方位成了又一重头戏。据透露，在近几年对神宫监的钻探研究中，文物工作者们发现了两处疑似神宫监的遗址。
由于该处遗迹是当时发现的靠近神宫的惟一建筑，所以文物工作者猜测该建筑很有可能就是神宫监的所在。然而，到了2000年春，研究人员又在神宫的西南角发现一片建筑遗迹，边宽一米左右的石柱础和少量的绿琉璃构件，这些绿琉璃跟孝陵里发现的一样。
（上图）神宫
距这片遗迹20米左右处，他们也发现了一口明代的水井。都有生活设施水井，而且靠近神宫，两处神宫监，到底谁是谁非？由于没有文献对神宫监的具体方位和数量作过记载，所以只有经过钻探、清理发掘以后才能对此作出正确判断。皇家陵墓历来是盗墓贼们觊觎的目标，然而令人奇怪的是，明朝灭亡以后，明孝陵地面建筑在历次战火中毁坏殆尽，庞大的孝陵地宫却仍然保存完好，排除了被盗之说。
