1882年春，左宗棠下令抽调部分军队，开赴句容，修浚赤山湖，“筑道土坝至麻培桥圩堤，修复下游桥闸，令相洄注，弭壅溃之患”。该项工程历时1年，到1883年3月完成。完工之日，左宗棠照例以其认真精神，亲至工地，“勘验新筑圩堤，长二十里有余”。他又指示，沿着圩埂移植桑秧，既护圩堤，又利于农桑。
对流经南京城的秦淮河，左宗棠也曾亲自乘船勘测，下令在秦淮河入江去路各关键所在地建起多座石闸，控制流量，导引清流。对南京、镇江一带濒江的圩堤沟道，也一一整修。这些水利工程期间左宗棠都曾多次去现场视察督导。
在大兴水利的同时，左宗棠率领军民，在南京城内大片荒地上，清理丈量，种植桑树、柏树、松树、杉树等数百万株，为防止水土流失、绿化南京，作出了贡献。
左宗棠任两江总督虽时间很短，却取得了很为可观的成绩。1883年中，他曾兴奋地写信告诉郭嵩焘：“农田水利一气呵成，……支干相承，上流下接，帅水之智，用士卒之力，瞬息改观也。莅事未满一年，而气象一新，较之兵灾之前，尚觉远胜。”
这番话并不夸张，就在1883年这一年，新修的江苏水利工程承受了一次洪水的严峻考验，发挥了极为良好的作用。“皖豫上游盛涨，加以蛟水，而下游免沉没之灾，圩田收成加倍，而浙直告粜之船踵至”。
