10月27日,美国海军对一艘苏联核潜艇投下了深水炸弹，核潜艇舰长以为战争已经爆发，决定发射舰上核导弹，由于大副执意不同意（按照当时苏联核潜艇的规章必须三位最高军官：舰长、政委、大副一致同意才能发射导弹），最后潜艇上浮来请示莫斯科的命令，这也是导弹危机中距离核战争最近的一次。这一次，美国一 方面同意赫鲁晓夫前两封信的条件，同时发出威胁：赫鲁晓夫必须在24小时内撤出导弹，否则“后果不堪设想”。图为一架美国直升机低空监视一艘苏联潜艇。
10月28日，赫鲁晓夫回函，表示已下令撤除在古巴的核武器。美国同意不入侵古巴，并秘密撤回部署在土耳其的导弹。最后，苏联拆除了所有的进攻性武器，正 在前往古巴途中的船只也接令回航。至此，古巴导弹危机正式宣告结束。此次危机历时13天，又称“13日危机”。图为11月1日，当美国U-2再次对原先发现的中程导弹发射场进行侦察拍照时，发现导弹已经拆除。
