11月26日，肯尼迪亲自探望了U-2机组成员，充分肯定了他们拍摄的照片在危机当中的作用。最后，肯尼迪授予了第4080战略联队总统通令嘉奖，同时给这次古巴导弹危机惟一的牺牲品，U-2侦察机飞行员鲁道夫·安德森颁发了空军十字勋章。图为11月6日，美国通过瑞士驻哈瓦那大使将安德森的遗体运回国内。
1962年12月29日，导弹危机过去一个半月之后，一百万古巴人在卡斯特罗的召集下在哈瓦那举行集会抗议美国。大国之间的妥协让古巴获得了宝贵的生存空间，也被国民视为一场伟大的胜利。而美苏两国则开始考虑如何避免类似的危机，并在华盛顿和莫斯科之间建立了美苏热线，直至1991年苏联解体，世界格局再次改变。
